מחלקת המיסים העקיפים ב- KPMG ישראל היא אחת ממחלקות המיסים העקיפים הגדולות בישראל. המחלקה כוללת רואי חשבון, עורכי דין ויועצי מס מומחים בתחום ונחשבת כגורם משמעותי בישראל המתמחה במיסים עקיפים. 
המומחים שלנו עוסקים בכל קשת המיסים עקיפים - מע"מ, מכס, מס קנייה, חוק הבלו וחוק המזומן. במסגרת עבודתה, המחלקה מייצגת לקוחות מול משרדי מע״מ והמכס בהליכי ביקורת וחקירות, בפניות לרשויות המע"מ והמכס לצורך קבלת החלטות מיסוי בנושאים מורכבים, קבלת הקלות, תיקוני דוחות וקבלת אישורים שונים. בנוסף, המחלקה מספקת חוות דעת ומזכרי מס, מעניקה ייעוץ בקשר לסוגיות מיסוי מורכבות וייעוץ שוטף בשלל סוגיות בעולם המיסים העקיפים, כגון בדיקת הסכמים, ליווי עסקאות ומיזוגים, ייעוץ לגבי מבני החזקות ובניית עסקאות המסייעים לפעול באופן אופטימאלי מבחינה מסויית.
המחלקה מורכבת מעובדים שעבדו בעבר ברשויות מע"מ וכן מעובדים שצמחו בשוק הפרטי, שילוב המאפשר למחלקה להכיר לעומק את המנגנונים והתהליכים של רשויות המע״מ הכוללים את הנהלים, המדיניות, הפרסומים "התורה שבעל פה" וכו', כדי לייצר ערך מוסף רב ללקוחות ולעזור להם לנהל את סיכוני המיסים העקיפים, תוך ציות מלא לחוק ומיסוי אופטימלי ולא עודף.